日本銀行当座預金とは、当座預金の一つ。金融機関が日本銀行に対して預金している当座預金のこと。「日銀当座預金」や「日銀当預」とも呼ばれている。
日本銀行当座預金に預けられている当座預金の残高は「日銀当座預金残高」と呼ばれる。
バブル崩壊後のデフレが続く中、日銀当座預金残高をもとにした金融市場調節方式が決定された。これにより日銀当座預金残高は金融市場調節の主な操作目標となっている。
また「補完当座預金制度」では、民間金融機関による日銀当座預金に、それまでは0％だった金利を 0.1％にすることが決定されている。