結論から申しますと、全く違いはありません。むしろ易しいぐらいです。

日本公庫は預金機能を持たない融資専門の政府系金融機関です。

赤字に陥って一般銀行の融資姿勢が厳しくなる時でも、日本公庫であれば実績さえあればきちんと折返し融資にも応じてくれます。

3分の2を返済すると自動的に「折返し融資はいかがですか？」という通知が届くぐらいです。

政府系金融機関の合併がもたらすメリット

また、大々的には申し上げられませんが...聞いた話によれば、中小企業公庫と合併したことで、同行内でテリトリーを争うことになってしまい、「あっちは予算達成したそうだぞ！」などという激が飛ぶとか飛ばないとか...。

「日本公庫が厳しい」という印象は、恐らく、新規開業融資がなかなか下りず、または失敗した方の印象に基づくものなのではないでしょうか。